产生孢子的无性生殖器官。在低等植物（包括藻类、菌类和地衣）中，多为单细胞结构，在高等植物（包括苔藓、蕨类、裸子和被子植物）中，均为多细胞结构，虽然在裸子和被子植物中通常把产生孢子的结构称做花粉囊（或花药）和珠心，但它们实质上就相当于孢子囊。因为在花粉囊中，由小孢子母细胞经减数分裂产生很多小孢子，可以看作小孢子囊；在珠心中，1个大孢子母细胞经过减数分裂产生4个大孢子，可以看作大孢子囊。